Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpl3P27659 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rpl3P27659 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl3P27659 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms