Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms