Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a1P19437 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms