Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18528 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18528 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P18528 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P18528 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms