Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrgnP13609 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms