Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms