Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms