Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms