Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms