Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms