Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms