Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefmP08553 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefmP08553 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NefmP08553 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NefmP08553 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NefmP08553 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NefmP08553 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NefmP08553 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms