Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csf1P07141 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csf1P07141 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms