Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Me1P06801 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Me1P06801 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Me1P06801 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Me1P06801 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me1P06801 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me1P06801 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms