Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa4P06798 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms