Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt10P02535 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt10P02535 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms