Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms