Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01679 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01679 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01679 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms