Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp8O89110 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp8O89110 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms