Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms