Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AvilO88398 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AvilO88398 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AvilO88398 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AvilO88398 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms