Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ly86O88188 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms