Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx3O70492 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx3O70492 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms