Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPAG9O60271 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPAG9O60271 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms