Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ldb2O55203 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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