Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif6O55135 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif6O55135 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms