Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1bO55017 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms