Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sp100O35892 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms