Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Klf9O35739 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Klf9O35739 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Klf9O35739 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms