Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stag2O35638 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stag2O35638 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms