Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Opn1mwO35599 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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