Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms