Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad6O35182 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms