Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Casq1O09165 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms