Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MttpO08601 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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