Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efna3O08545 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efna3O08545 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms