Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm3424L7N298 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3424L7N298 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms