Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm379J3QQ19 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm379J3QQ19 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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