Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms