Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5849J3QPE5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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