Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm21060J3KMU4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21060J3KMU4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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