Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf4bG5E8Z2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf4bG5E8Z2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms