Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sclt1G5E861 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms