Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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