Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms