Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp17lbE9Q9U0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp17lbE9Q9U0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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