Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms