Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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