Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Ddx60E9PZQ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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