Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8994E9PV04 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8994E9PV04 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms